S1线功能定位台州中心城区南北向快速轨道通道和市区南向联络温岭、玉环的快速轨道通道，串联头门港区、台州站、温岭站等重要综合交通节点。S2线功能定位台州市中心城区东西向快速轨道通道，串联黄岩城区、台州西站、椒江城区（台州站）、台州湾新区、金清、温岭东部新区、松门、石塘等重要区块及场站，与S1线共同构筑了台州市区十字快速轨道。S3线功能定位是临海市中心城区与台州市中心城区联系的快速轨道交通通道，串联起临海站、临海南站、台州站等重要交通节点。

M线主要是服务“三区两市”的轨道普线。M1线功能定位是连接黄岩城区、椒江城区的东西向轨道交通线；M2线功能定位是连接台州西站、黄岩城区、路桥城区、台州机场、台州湾新区的东西向轨道交通线；M3线功能定位是连接江北新区、椒江城区、路桥城区、温岭市区的南北向轨道交通线；M4线功能定位是连接黄岩城区、院（桥）沙（埠）高（桥）区块、鉴洋湖、路桥城区、台州机场的轨道交通线；M5线功能定位是温岭市内部的一条东西向轨道交通线，串联温岭东部新区、箬横镇、温岭城区、温岭站、大溪镇等。

台州市城市轨道交通近期实施的基本指导思想是：尽快形成以主城中心为核心向外放射的骨架线网，构建支撑城市向外拓展和服务城市客流为主的城市轨道交通主骨架，使台州市具备满足基本交通需求的线网规模，形成以轨道交通为骨干的公共交通网，支撑做大做强中心城区，支持和引导城市的发展。